Arnaud Runge passe son bac en 1998. Inscrit en prépa, il candidate à l’ENAC, mais la conjoncture n’est pas favorable pour les pilotes. Il s’oriente alors vers le domaine médical, son autre passion, et réussit en 2001 l’entrée à l’Institut Supérieur d’Ingénieurs de Franche-Comté (ISIFC), une nouvelle école qui enseigne à la fois le médical et l’ingénierie. Sa route croise celle d’un professeur en physiologie aéronautique. Cela le motive à monter avec des amis une expérience scientifique qui leur permet d’accéder à des vols paraboliques sur l’Airbus A300 « Zéro-G » : Arnaud se rend compte que ses deux centres d’intérêt sont compatibles. Il postule à l’Agence Spatiale Européenne (ESA) pour son stage de fin d’études. Il y fera des recherches sur les vêtements intelligents pour les futures missions d’exploration du système solaire. Tout premier diplômé de l’ISIFC en 2004 (major de promo), on lui propose un poste d’ingénieur médical aux Pays-Bas à la Direction des Vols Habités.
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